在植物大战僵尸的小镇上，生活着这样一位懒惰的植物仙子。每次遇到任务，她总是能躲就躲。尽管自己的歌声拥有神奇的迷惑效果，莉莉却只是用它来处理一些无关紧要的问题，因此大家都很不看好她。

这天，在其他植物们讨论和僵尸的作战安排时，莉莉又偷偷溜走了。她以为自己很安全，却不知道有一只僵尸正摇摇晃晃地向她走来。莉莉发现后，急忙用歌声迷惑住了僵尸。“我是谁？我怎么会在这儿？”僵尸迷惑地问道。莉莉才不管这僵尸为什么突然恢复了理智，直接把他推到了陷阱里。

“别把我留在这儿，我害怕僵尸。” “你当我是傻的吗？你自己不就是僵尸？”莉莉不相信他说的，但又突然注意到了僵尸手臂上的缠绕海藻。它们属于自己最好的朋友杰克，莉莉已经很久没有见到杰克了，她心里很担心，可这只僵尸又失去了所有的记忆。所以莉莉决定暂时把这个看起来并不危险的僵尸伪装成南瓜精灵留在自己身边。

莉莉的伪装术非常高超，就连最挑剔的高坚果都没有发现破绽，而南瓜也和大家相处得很愉快，所有人都很喜欢它。有一次，莉莉不小心招惹了一大群蜜蜂，还好南瓜及时冲出来挡在了前面，莉莉这才想起来用歌声控制蜜蜂。后来在南瓜的建议下，她又用自己的能力让蜜蜂帮助其他植物完成他们的工作。

托马斯博士是植物们的创造者，每个月的月底，他都会召集大家到自己的研究所来开会。马上就是万圣节了，僵尸们在这段时间活动会更频繁。“作为未来的英雄，让我们一起为城市的安宁奋斗吧。”莉莉想要向博士询问杰克的下落，可博士在结束演讲后就径自回了自己的实验室，莉莉只能和南瓜偷偷去实验室找线索。

里面的情景却把他们吓了一跳。博士竟然正在调制一种可以把植物变成僵尸的绿色液体。实验室的角落还有一个奇怪的机器，旁边掉落着一份文件。通过文件，两人了解到，博士其实是因为自己的研究被别人嘲笑才搬到了这个小镇上。他制造出这些僵尸，就是想让人们都把他当成可以拯救大家的英雄。

莉莉和南瓜把这件事情告诉了其他植物，可他们全都不相信。但发现自己的实验室被人闯入过的博士却失去了耐心，他带着机器人把所有的植物都抓了起来。不受影响的南瓜又偷偷把大家救了出来。眼见自己的计划被人打破，博士立刻用实验室的奇怪仪器召唤出许多僵尸拦住了植物们，然后趁机跑向自己的实验室。

南瓜带着莉莉冲过僵尸群，一路追到实验室，博士却在这时跳进了溶液里，把自己也变成了一只僵尸。早就已经对自己做过改造的他并不会因此丧失理智，反而还能获得更强大的力量。可南瓜却不怕博士，此时的他只想拼尽全力去保护那些比自己还要重要的朋友们。

在打败博士后，莉莉和南瓜又用实验室里的解药把僵尸们都变回了原样。原来他们竟然是那些被博士宣称送去外地参加战斗的植物。再次接触了绿色溶液的南瓜并没能变回去，但他也终于想起自己就是莉莉曾经最好的朋友缠绕海藻杰克。

之后，植物们一起庆祝了万圣节，这些好朋友们将永远幸福地生活在一起。

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